Protocoles alternatifs pour les matrices difficiles

Exemples de matrices qui peuvent tirer parti des protocoles alternatifs :

• Riche en GC : une matrice dont la teneur en GC est supérieure à 60 % ou élevée et concentrée dans une petite région.
• Structures en épingle à cheveux : une séquence contenant deux répétitions inversées, séparées par au moins trois nucléotides.
• Répétitions : certaines répétitions binucléotidiques ou trinucléotidiques.
• Motifs causant les compressions de bandes : principalement les motifs 5'-YGN1-2AR (Y : pyrimidine ; R : purine ; N : n'importe quelle base)
• Chromosomes bactériens artificiels (BAC) : toute construction supérieure à 50 kb.

Exemples de matrices

Cas 1 : séquençage de matrices de petits ARN en épingle à cheveux (ARNsh)

Les matrices de petits ARN en épingle à cheveux utilisées dans les études sur l'interférence par ARN présentent des difficultés en matière de séquençage, notamment l'interruption anticipée et l'ambiguïté, causée par les structures bicaténaires ou en épingle à cheveux. Notre protocole d'interférence par ARN propriétaire produit des résultats supérieurs pour nos clients, leur permettant ainsi d'économiser du temps et de l'argent. Pour une comparaison, consultez le chromatogramme ci-dessous : 

Cas 2 : séquençage de matrices de répétitions/riches en GC

Les matrices de répétitions/riches en GC ont des températures de fusion et des structures secondaires spéciales. L'ADN ayant une teneur en GC élevée et les structures en épingle à cheveux sont relativement plus difficiles à dénaturer et à séquencer. 

Nos protocoles pour les matrices riches en GC et en épingle à cheveux produisent des résultats supérieurs, avec des signaux puissants et des hauteurs de crête uniformes dans la région GC.